El titular de la Conferencia Episcopal Peruana (CEP), monseñor Miguel Cabrejos, negó que la organización que preside haya emitido un pronunciamiento respecto del conflicto judicial entre el Arzobispado de Lima y la Pontificia Universidad Católica del Perú (PUCP). Por medio de una nota de prensa, Cabrejos manifestó la necesidad de incidir en este tema, para evitar confusiones al respecto, puesto que anteriormente, el obispo de Chimbote, Jesús Moliné, había declarado que la CEP había acordado hacer público su respaldo al Arzobispado.
En ese sentido, Cabrejos Iriarte sólo expresó sus deseos para que el caso sea resuelto de la mejor forma, y resaltó que era un asunto netamente judicial. Asimismo, hizo un llamado a las partes litigantes, para llegar a una solución que beneficie a la comunidad estudiantil de esta institución.
El Arzobispado de Lima reclama ser parte de la Junta Administradora de la PUCP, sustentándose en el testamento del benefactor de esta casa de estudios, José De la Riva Agüero, en el que dispone que dicha junta debe estar conformada por un integrante de la universidad y otro del Arzobispado.
Sin embargo, la PUCP sostiene que esta junta no tiene razón de ser, pues argumentan que en el mismo testamento de Riva Agüero se señala que la universidad pasa a ser autónoma si subsiste dos décadas después de la muerte del intelectual limeño, acaecida en 1944.